By超神经
场景描述:利用机器学习的方法,对病理学中的组织样本切片显微图像,进行虚拟染色,从而来避免传统染色方法的弊端。辅助医疗人员更便捷的进行诊断。
关键词:CNN,图像处理,医疗辅助
医学上的诊断,有很多是通过图像观察的过程。而提到图像处理,那AI就大有用武之地。
在活体组织切片观察的病理学检查中,需要对样本的极薄切片进行染色,然后用显微镜观察图像以进行病理诊断。这个问题从AI的角度来看,就是一个图片准确上色的问题。
在最近的一项报道中,研究人员通过机器学习的方法,对切片的虚拟染色获得了极高的准确度,基本可以代替人工的染色过程。
传统的组织样本切片染色
组织样本的显微成像是用于诊断各种疾病的基本工具,并且是病理学和生物科学的常用使用方法。
具体的操作就是取下很小一块身体组织,通过对这个样本的处理分析,以达到检查和诊断的目的。
传统的染色方法有严格的过程和操作
取出样本后,要将其切成薄片,其厚度为几个微米(百万分之一米)。这些薄的组织切片在微观尺度上包含了患者状况的信息。
而在标准光学显微镜下,未处理的切片几乎分辨没有区别。只能用染色的方法来增加辨识度,在历经多年的病理学中发展中,医生们创建了很多种组织染色方法。
但组织标本的传统染色过程耗时而且复杂,需要有专门的实验室基础设施,化学试剂以及训练有素的技术人员。
用AI实现数字染色
那么AI是怎么进行染色的呢?
虚拟图像染色利用了机器学习的方法,通过使用之前染色的资料,用深度卷积神经网络(CNN)对样品的单个自发荧光图像进行上色。
在操作时,先对未染色的组织切片,先拍摄出它自发荧光下的显微图像。
然后用生成对抗网络(GAN)训练的CNN,就可以快速的将未标记的组织切自发荧光图像,转换成类似试剂染色的图像。
AI虚拟染色的流程图
这种基于深度学习的方法,完全没有传统步骤的繁琐,通过计算机训练模型,最终输出上色后的图样,能极大的节省成本和时间。
该研究由加州大学洛杉矶分校的研究团队完成,研究成果发表在了NatureBiomedicalEngineering杂志上。